Генетический код Кыргызов - R1a1a Z93+Z2125+S23592+S23201+YP1456+ Скифы. Гаплотипы носителей андроновской и тагарской культур имеют наибольшее близость к гаплотипам южных алтайцев и тяньшанских кыргызов. Наблюдается близкая генетическая связь между представителями гаплогруппы R1a1a, населяющими территорию Средней, Центральной, Южной и Передней Азии. Эта связь обусловлена принадлежностью к одному субкладу R-L342.2. Cубклад R-L342.2 является общим компонентом, присутствующим у современных тюркских и индо-иранских народов. Антропологический типа населения каждой из этих центрально-азиатских культур, многие исследователи признают в основном европеоидный облик их населения. При этом археологи указывают на их антропологическое происхождение из более ранней андроновской культуры. Преобладающим у тагарцев являлся европеоидный тип, по некоторым оценкам, восходящий к носителям андроновской культуры Y-хромосомная гаплогруппа R1a-R1a1a (M198), доминирующая у тагарцев, была впервые привнесена в Минусинскую котловину носителями андроновской (фёдоровской) культуры. Образец RISE386, относящийся к поселению Буланово-Синташтинской культуры (Южный Урал) «датирован 2298-2045 годами нашей эры и относится к субкладу Z2121/S3410+ Z2124+, YP1460+. YP1460 является позитивным для кыргызской ветви».
